Síntesis de pirimidinas
Estamos a mitad de metabolismo de las bases nitrogenadas, habíamos dicho que se podían
recuperar de la dieta, las vías de salvamento.
Síndrome de lesch nyhan, deficiencia de la HGPRT (hipoxantina-guanina-fosforribosil-transferasa),
que sirve para que cuando no haya suficientes nucleótidos en la dieta, toca sintetizarlos, porque
estos son muy importantes.
Los ribunucleotidos llevan a cabo varias funciones importantes, como moneda energética,
segundos mensajeros, coenzimas y a partir de estos hacemos deoxiribonucleótidos, que funden
una sola función fundamental, siendo utilizados para hacer DNA.
Como se hacen las pirimidinas y los deoxiribonucleótidos?
Las pirimidinas son mucho más sencillas que las purinas, y se hacen a partir de aminoácidos,
principalmente del asparato, que mete completo; y también participa la glutamina que dona un
amino para poder hacer el carbamil fosfato.
El ciclo de la urea tiene una primera etapa en matriz mitocondrial, donde se libera el amino del
glutamato y de la glutamina y este amino se hace carbamil fosfato que se condensa con ornitina y
forma citrulina.
En síntesis de purinas y pirimidinas está en el citoplasma del hepatocito.
Entonces la enzima que hace carbamil del ciclo de la urea (en mitocondria) es carbamil fosfato
sintetasa 1 y se activa con N acetil glutamato, y la enzima que lo hace en citoplasma es la carbamil
fosfato sintetasa 2, y esta es para la síntesis de pirimidinas (2:40). La reacción es exactamente la
misma.
El carbamil fosfato se condensas con el aspartato, formando la primera pirimidina, y esta la
sintetizamos sin el PRPP, lo cual es una gran diferencia entre síntesis de purinas y de pirimidinas.
Las purinas se sintetizan sobre el PRPP (PR por que el PP sale en la primera reacción), pero acá no,
hacemos el anillo primero y luego lo ponemos sobre el PRPP, sale el PP y queda un nucleótido
monofosfato de uracilo, que se fosforila 2 veces y queda nucleótido trifosfato de uracilo (UTP), y a
este se le cambia un grupo ceto por un amino donado por la glutamina y obtenemos nucleótido de
citosina (CTP).
Por esto los aminoácidos son tan importantes para la síntesis de las purinas y pirimidinas.
A partir de los correspondientes ribunucleotidos vamos a hacer los deoxiribonucleótidos, tanto
para ribunucleotidos purinicos como pirimidinicos.
, Esta es la reacción que ya conocemos, pero está pasando en citoplasma entonces es la carbamil
fosfato sintetasa II. Bicarbonato se une con ATP para formar carboxifosfato, que es el
intermediario en el sitio activo, luego llega el amino (sale un fosfato) y se forma ácido carbamico, y
a este se le pega un fosfato del ATP y tenemos carbamil fosfato.
La carbamil fosfato sintetasa 2 es monocatenaria y tiene 3 dominios claramente distinguidos, tiene
en su centro una línea virtual, que no existe realmente, pero que representa un carril de
aminoácido hidrofilicos donde hay agua, formando una calle de honor para el amonio y evitar que
se salga de la enzima, porque si lo hace este cae citoplasma y de ahí a sangre y cagada.
En el primer dominio llega la glutamina, se le quita el grupo amida y sale glutamato. Este amida
queda NH3, se protona (NH4-Amonio supongo) y baja por el canal. En el segundo dominio se
forma el ácido carbamico y al final en el tercer dominio se forma carbamil fosfato
Una vez tenemos carbamil fosfato, hay que condensarlo con aspartato (ya está activado por el
fosfato) para formar Carbamilasparato. Hay que tener en cuenta que el aspartato no pierde nada.
Esta reacción es supremamente importante, la enzima que la cataliza es la enzima regulada en la
ruta y es la aspartato transcarbamilasa.
Ya tenemos casi que el anillo pirimidinicos, es no más cerrar el enlace, y para esto llega la enzima
dihidroorotasa, que coge un oxígeno, además entra un protón (H+) y se van con otro protón, de
modo que donde había NH2 queda NH, y con el protón que entro más el oxígeno se forma una
molecula de agua y se cierra el anillo, y lo que queda ya es una base pirimidinica, el dihroorotato.
Estamos a mitad de metabolismo de las bases nitrogenadas, habíamos dicho que se podían
recuperar de la dieta, las vías de salvamento.
Síndrome de lesch nyhan, deficiencia de la HGPRT (hipoxantina-guanina-fosforribosil-transferasa),
que sirve para que cuando no haya suficientes nucleótidos en la dieta, toca sintetizarlos, porque
estos son muy importantes.
Los ribunucleotidos llevan a cabo varias funciones importantes, como moneda energética,
segundos mensajeros, coenzimas y a partir de estos hacemos deoxiribonucleótidos, que funden
una sola función fundamental, siendo utilizados para hacer DNA.
Como se hacen las pirimidinas y los deoxiribonucleótidos?
Las pirimidinas son mucho más sencillas que las purinas, y se hacen a partir de aminoácidos,
principalmente del asparato, que mete completo; y también participa la glutamina que dona un
amino para poder hacer el carbamil fosfato.
El ciclo de la urea tiene una primera etapa en matriz mitocondrial, donde se libera el amino del
glutamato y de la glutamina y este amino se hace carbamil fosfato que se condensa con ornitina y
forma citrulina.
En síntesis de purinas y pirimidinas está en el citoplasma del hepatocito.
Entonces la enzima que hace carbamil del ciclo de la urea (en mitocondria) es carbamil fosfato
sintetasa 1 y se activa con N acetil glutamato, y la enzima que lo hace en citoplasma es la carbamil
fosfato sintetasa 2, y esta es para la síntesis de pirimidinas (2:40). La reacción es exactamente la
misma.
El carbamil fosfato se condensas con el aspartato, formando la primera pirimidina, y esta la
sintetizamos sin el PRPP, lo cual es una gran diferencia entre síntesis de purinas y de pirimidinas.
Las purinas se sintetizan sobre el PRPP (PR por que el PP sale en la primera reacción), pero acá no,
hacemos el anillo primero y luego lo ponemos sobre el PRPP, sale el PP y queda un nucleótido
monofosfato de uracilo, que se fosforila 2 veces y queda nucleótido trifosfato de uracilo (UTP), y a
este se le cambia un grupo ceto por un amino donado por la glutamina y obtenemos nucleótido de
citosina (CTP).
Por esto los aminoácidos son tan importantes para la síntesis de las purinas y pirimidinas.
A partir de los correspondientes ribunucleotidos vamos a hacer los deoxiribonucleótidos, tanto
para ribunucleotidos purinicos como pirimidinicos.
, Esta es la reacción que ya conocemos, pero está pasando en citoplasma entonces es la carbamil
fosfato sintetasa II. Bicarbonato se une con ATP para formar carboxifosfato, que es el
intermediario en el sitio activo, luego llega el amino (sale un fosfato) y se forma ácido carbamico, y
a este se le pega un fosfato del ATP y tenemos carbamil fosfato.
La carbamil fosfato sintetasa 2 es monocatenaria y tiene 3 dominios claramente distinguidos, tiene
en su centro una línea virtual, que no existe realmente, pero que representa un carril de
aminoácido hidrofilicos donde hay agua, formando una calle de honor para el amonio y evitar que
se salga de la enzima, porque si lo hace este cae citoplasma y de ahí a sangre y cagada.
En el primer dominio llega la glutamina, se le quita el grupo amida y sale glutamato. Este amida
queda NH3, se protona (NH4-Amonio supongo) y baja por el canal. En el segundo dominio se
forma el ácido carbamico y al final en el tercer dominio se forma carbamil fosfato
Una vez tenemos carbamil fosfato, hay que condensarlo con aspartato (ya está activado por el
fosfato) para formar Carbamilasparato. Hay que tener en cuenta que el aspartato no pierde nada.
Esta reacción es supremamente importante, la enzima que la cataliza es la enzima regulada en la
ruta y es la aspartato transcarbamilasa.
Ya tenemos casi que el anillo pirimidinicos, es no más cerrar el enlace, y para esto llega la enzima
dihidroorotasa, que coge un oxígeno, además entra un protón (H+) y se van con otro protón, de
modo que donde había NH2 queda NH, y con el protón que entro más el oxígeno se forma una
molecula de agua y se cierra el anillo, y lo que queda ya es una base pirimidinica, el dihroorotato.
