1. Henderson Hasselbalch vergelijking maar met dissociatiegraad alfa ipv base/acid.
FUNCTIE= verhouding berekenen base/ geconjugeerd zuur
ZUUR= log A-/ HA
BASE= log B/ BH+
Alfa geeft de fractie zuur of base aan die een waterstofion heeft afgeven (A- of B). Als de pH
hoog is (weinig waterstofionen), dan is alfa hoog -> meest voorkomende vorm is A- of B.
Dus de verhouding alfa/ 1- alfa is hetzelfde als de verhouding A-/HA en B/BH+.
2. Cheng-Prosoff
FUNCTIE= met IC50 de inhibitorconstante
Ki berekenen
Grafiek gemaakt door een test met een
constante concentratie agonist en een
toenemende concentratie inhibitor. De IC50 is het punt waarop de helft van de RL-binding in
de eerste buis (alleen agonist en geen inhibitor) is verdrongen. Dus je stelt het eerste
meetpunt zonder inhibitor op: fractie RL = 1. Bij fractie 0,5 aka de helft van het bovenste
plateau is IC50 af te lezen. IC50 is NIET Ki!! Ki is te berekenen met de formule.
Hoe lager IC50, hoe lager Ki -> hoe sterker de inhibitor. [L] is de vaste concentratie agonist
aka ligand tijdens de test. IC50 is NIET constant, bij een hogere [L] heb je ook een hogere
concentratie [I] nodig om 50procent RL te verdringen (want je hebt meer RL dus meer I
nodig ofcourse). Ki is CONSTANT net zoals dat Kdis constant is.
Ki is net zoals Kdis de concentratie waarop 50 procent van de receptoren gebonden zijn aan
het ligand.
, 3. LANGMUIR kromme vergelijking
FUNCTIE= vergelijking voor de kromme, Kdis berekenen
met [L50]
Y-as = RL, x-as = L, asymptoot = Rtot
Kdis is de ligandconcentratie waarop RL/Rtot = 0.5, oftewel de helft van alle receptoren zijn
gebonden. In grafiek af te lezen door de x-as punt die ligt op de helft van de asymptoot.
6. Scatchard
FUNCTIE= makkelijker Kdis berekenen door lineaire regressie via rekenmachine en
kan meetfouten dempen vanwege rechte lijn tov een asymptoot
Helling is -1/Kdis -> hoe steiler de lijn hoe hoger de affiniteit. Snijpunt met de x-as is
Rtotaal. Met rekenmachine geeft B= -1/Kdis. Vervolgens geeft A= Rtot/Kdis, je kan Rtot
berekenen omdat je Kdis hebt.
INHIBITIEEEEEE met langmuir
FUNCTIE= verhouding berekenen base/ geconjugeerd zuur
ZUUR= log A-/ HA
BASE= log B/ BH+
Alfa geeft de fractie zuur of base aan die een waterstofion heeft afgeven (A- of B). Als de pH
hoog is (weinig waterstofionen), dan is alfa hoog -> meest voorkomende vorm is A- of B.
Dus de verhouding alfa/ 1- alfa is hetzelfde als de verhouding A-/HA en B/BH+.
2. Cheng-Prosoff
FUNCTIE= met IC50 de inhibitorconstante
Ki berekenen
Grafiek gemaakt door een test met een
constante concentratie agonist en een
toenemende concentratie inhibitor. De IC50 is het punt waarop de helft van de RL-binding in
de eerste buis (alleen agonist en geen inhibitor) is verdrongen. Dus je stelt het eerste
meetpunt zonder inhibitor op: fractie RL = 1. Bij fractie 0,5 aka de helft van het bovenste
plateau is IC50 af te lezen. IC50 is NIET Ki!! Ki is te berekenen met de formule.
Hoe lager IC50, hoe lager Ki -> hoe sterker de inhibitor. [L] is de vaste concentratie agonist
aka ligand tijdens de test. IC50 is NIET constant, bij een hogere [L] heb je ook een hogere
concentratie [I] nodig om 50procent RL te verdringen (want je hebt meer RL dus meer I
nodig ofcourse). Ki is CONSTANT net zoals dat Kdis constant is.
Ki is net zoals Kdis de concentratie waarop 50 procent van de receptoren gebonden zijn aan
het ligand.
, 3. LANGMUIR kromme vergelijking
FUNCTIE= vergelijking voor de kromme, Kdis berekenen
met [L50]
Y-as = RL, x-as = L, asymptoot = Rtot
Kdis is de ligandconcentratie waarop RL/Rtot = 0.5, oftewel de helft van alle receptoren zijn
gebonden. In grafiek af te lezen door de x-as punt die ligt op de helft van de asymptoot.
6. Scatchard
FUNCTIE= makkelijker Kdis berekenen door lineaire regressie via rekenmachine en
kan meetfouten dempen vanwege rechte lijn tov een asymptoot
Helling is -1/Kdis -> hoe steiler de lijn hoe hoger de affiniteit. Snijpunt met de x-as is
Rtotaal. Met rekenmachine geeft B= -1/Kdis. Vervolgens geeft A= Rtot/Kdis, je kan Rtot
berekenen omdat je Kdis hebt.
INHIBITIEEEEEE met langmuir
