Microben
Algemene microbiologie
MRSA
- Methiccillin-resistente Straphylococcus aurus.
- Is resistent voor heel veel antibiotica lastig te bestreiden
Streptococcus ppneumoniae = longontsteking
Mycobacterium tuberculosis = tuberculose
Salmonella typhimurium = voedselvergiftiging
Escherichia coli = voedselvergiftiging
Helicobacter pylori = maagzweer
Neisseria gonorrhoeae = gonorroe
Legionella pneumophilia = veteranenziekte
HAemophilus influenzae = hersenvliesontsteking
Bacilluc anthracis = miltvuur (antrax)
Bacilluc anthracis:
- Een van de ziekteverschijnselen is een opgezwollen en ontstoken milt en dit kan
leiden tot dood.
- Bacterie verspreidt zich door middel van endosporen
- Nadat ze in de lymfevaten terecht zijn gekomen, scheiden ze toxines uit
beschadigen de bloedbaan inwendige bloedingen
- Komen veel voor in de grond
Candia albicans:
- Is normaal aanwezig in evenwicht op de huid, n de mond en op de vagina met andere
bacteriën
- Als reactie op een zwak immuunsysteem kan het een pathogeen vormen schimmel
- Normaal is het in een gistvorm
Fusarium / Phytophthora
Fusarium is een geslacht van parasiterende schimmels die in de bodem voorkomen en die
planten en dieren kunnen aantasten. Daarnaast produceren ze ook mycotoxines die voedsel
kunnen besmetten
Plasmodium falciparum:
- Ééncellig
- Is de verwekker van malaria tropica bij mensen
- Een van de gevaarlijkste eukaryote protozoa bij de mens
,Trypansoma brucei:
- Slaapziekte
- Ééncellig
- De verschillen tussen de oppervlakte-eiwitten van de cekken van het bloed van
zoogdieren zorgen ervoor dat de parasiet antigene variatie ondergaat adaptieve
immuunsysyteem wordt omzeilt chronische infectie ontstaat
Leishmania major:
- Intracellulaire pathogeen
- Infecteert dendritische cellen en mactrofagen van het immuunsysteem
- Veroorzaakt knobbels op de huid
Voorbeelden van virusinfecties bij de mens
1. Hepatitis
2. Dengue
3. HIV
4. Polio
5. Mazelen
Immunisatie = de simmulering van een immuunrespons door opzettelijke inenting met een
verzwakt ziekteverwekker.
Pasteur
Heeft een samenstelling gemaakt, waarbij wel lucht bij het medium kon komen, maar geen
bacteriën uit de lucht. Er kan dus geen spontane generatie zijn ontstaan. Hij heeft de
vaccinatie bedacht, pasteurisatie en ook de isomerisatie van chemische verbindingen
bedacht.
Symbiose
Schimmels kunnen in symbiose met elkaar leven. Dit gebeurt bijvoorbeeld bij korstmossen
(Lichens)
Lichens
- Leven in symbiose: moode bloemen ontstaan
- Schimmel die op de boom een symbiose met algen aangaat
Rhizobium
- Omvat wortelknobbelbacteriën uit de familie van de Rhizobiaceae
- Stikstof zit voor 80% in de lucht en dit kan alleen omgezet worden door deze
bacteriën
Micorrhiza
- Samenlevingsvorm van schimmels en planten via de wortels
- Bijna alle planten werken ondergronds samen met schimmels
- Absorberen bijvoorbeeld mineralen uit de bodem die ze vervolgend afstaan aan
een plant in ruil daarvoor krijgen ze suikers terug voor hun eigen voeding.
,Microbiome
- Essentieel voor symbiose bij hogere organismen
1. Darmflora / microbiota
2. Orgaan microbioom (~ 500 soorten)
3. Lichaam microbioom
Flemming
In 1929 ontdekte Alexander Flemming dat Penicillium schimmel een stof voortbracht die
bacteriën doodt.
Micriobiële schaal
1. Prochlorococcus marinus 0,4 micrometer
2. Staphylococcus aureus 0,9 micrometer
3. Escherichia coli 2,5 micrometer
4. Bacillus megaterium 4 micrometer
5. Rode bloedcel 8 micrometer
6. Paramecium 100 micrometer
Hoocke cell
Antonie van Leeuwenhoek heeft een single-lens gemaakt, waarmee hij single-celled
microben kon waarnemen.
Robert Hooke vond het woord ‘’cell’’ ui en ook verschillende lezen.
Standaard vormen van bacteriën
Golflengte van zichtbaar licht ~ bacteriële cel
Als je iets wilt zien, moet het groter zijn dan de golflengte die je gebruikt om het gene te
zien. Voor bacteriën zou dat betekenend dat je een hele kleine golflengte nodig zou hebben.
Een golflengte van 10^5 heeft het licht wat wij kunnen waarnemen.
Bright field mycroscopi
- Microscopie die de eenvoudigste is van de reeks techonologiën.
- Het typische uiterlijk an een helderveldmicroscopiebeeld is een donker monster op
een heldere achtergrond komt de naam vandaan
Oil emersion
- Wordt gebruikt bij lichtmicroscopie
, - Immersieolie heeft een bepaalde brekingsindex, waardoor er genoeg licht in de lens
valt om de bacterie waar te nemen.
Gram strain
Als je naar een bacterie wilt kijken, moet je de celwand een kleur geven
Gram negatief: celwand is heel dun (E.coli)
Gram positief: celwand is heel dik (B.subtilis)
Negative strain = kleurt de achtergrond, waardoor de capsules beter waarneembaar worden
gemaakt.
DAPI
- Afkorting van 4,6-diamindino-2-fenylindool een fluorescerende stof die vooral aan
chromatine bindt
- Bij fluorescente microscopie absorbeert het monster licht met een golflengte en
zendt vervolgens licht uit met een lagere energie, dus grotere golflengte
Immunflofluorescence
- Fluoresence microscopie: DNA in de kern is gekleurd
- Fluorphore = het fluorescente bestandmiddel
- Immunofluorescence = maakt gebruik van de specifiteit van antilichamen tegen hun
antigenen om fluorescente kleurstoffen te tichten op specifieke biomoleculen in een
cel.
o Maakt visualisatie van de distributie van het doelmolecuul door het monster
mogelijk.
- Primary antibody = het antilichaam die aan de antigeen zit
- Secondary antibody = het antilichaam die aan de primary antibody zit met een
marker aan zich gevestigd.
GFP
- Komt uit een kwal
- Green Fluorescent Protein
- Komt alleen tot expressie als alle voedingsstoffen op zijn daardoor die je alleen de
nieuwe cellen
- GFP-fusie maakt onderzoek naar eiwitlocatie mogelijk
Phase contrast microscope
Onthult verschillen in brekingsindex als patronen van licht en donker kan worden gebruikt
om levende cellen en cellulaire organellen te bekijken.
Algemene microbiologie
MRSA
- Methiccillin-resistente Straphylococcus aurus.
- Is resistent voor heel veel antibiotica lastig te bestreiden
Streptococcus ppneumoniae = longontsteking
Mycobacterium tuberculosis = tuberculose
Salmonella typhimurium = voedselvergiftiging
Escherichia coli = voedselvergiftiging
Helicobacter pylori = maagzweer
Neisseria gonorrhoeae = gonorroe
Legionella pneumophilia = veteranenziekte
HAemophilus influenzae = hersenvliesontsteking
Bacilluc anthracis = miltvuur (antrax)
Bacilluc anthracis:
- Een van de ziekteverschijnselen is een opgezwollen en ontstoken milt en dit kan
leiden tot dood.
- Bacterie verspreidt zich door middel van endosporen
- Nadat ze in de lymfevaten terecht zijn gekomen, scheiden ze toxines uit
beschadigen de bloedbaan inwendige bloedingen
- Komen veel voor in de grond
Candia albicans:
- Is normaal aanwezig in evenwicht op de huid, n de mond en op de vagina met andere
bacteriën
- Als reactie op een zwak immuunsysteem kan het een pathogeen vormen schimmel
- Normaal is het in een gistvorm
Fusarium / Phytophthora
Fusarium is een geslacht van parasiterende schimmels die in de bodem voorkomen en die
planten en dieren kunnen aantasten. Daarnaast produceren ze ook mycotoxines die voedsel
kunnen besmetten
Plasmodium falciparum:
- Ééncellig
- Is de verwekker van malaria tropica bij mensen
- Een van de gevaarlijkste eukaryote protozoa bij de mens
,Trypansoma brucei:
- Slaapziekte
- Ééncellig
- De verschillen tussen de oppervlakte-eiwitten van de cekken van het bloed van
zoogdieren zorgen ervoor dat de parasiet antigene variatie ondergaat adaptieve
immuunsysyteem wordt omzeilt chronische infectie ontstaat
Leishmania major:
- Intracellulaire pathogeen
- Infecteert dendritische cellen en mactrofagen van het immuunsysteem
- Veroorzaakt knobbels op de huid
Voorbeelden van virusinfecties bij de mens
1. Hepatitis
2. Dengue
3. HIV
4. Polio
5. Mazelen
Immunisatie = de simmulering van een immuunrespons door opzettelijke inenting met een
verzwakt ziekteverwekker.
Pasteur
Heeft een samenstelling gemaakt, waarbij wel lucht bij het medium kon komen, maar geen
bacteriën uit de lucht. Er kan dus geen spontane generatie zijn ontstaan. Hij heeft de
vaccinatie bedacht, pasteurisatie en ook de isomerisatie van chemische verbindingen
bedacht.
Symbiose
Schimmels kunnen in symbiose met elkaar leven. Dit gebeurt bijvoorbeeld bij korstmossen
(Lichens)
Lichens
- Leven in symbiose: moode bloemen ontstaan
- Schimmel die op de boom een symbiose met algen aangaat
Rhizobium
- Omvat wortelknobbelbacteriën uit de familie van de Rhizobiaceae
- Stikstof zit voor 80% in de lucht en dit kan alleen omgezet worden door deze
bacteriën
Micorrhiza
- Samenlevingsvorm van schimmels en planten via de wortels
- Bijna alle planten werken ondergronds samen met schimmels
- Absorberen bijvoorbeeld mineralen uit de bodem die ze vervolgend afstaan aan
een plant in ruil daarvoor krijgen ze suikers terug voor hun eigen voeding.
,Microbiome
- Essentieel voor symbiose bij hogere organismen
1. Darmflora / microbiota
2. Orgaan microbioom (~ 500 soorten)
3. Lichaam microbioom
Flemming
In 1929 ontdekte Alexander Flemming dat Penicillium schimmel een stof voortbracht die
bacteriën doodt.
Micriobiële schaal
1. Prochlorococcus marinus 0,4 micrometer
2. Staphylococcus aureus 0,9 micrometer
3. Escherichia coli 2,5 micrometer
4. Bacillus megaterium 4 micrometer
5. Rode bloedcel 8 micrometer
6. Paramecium 100 micrometer
Hoocke cell
Antonie van Leeuwenhoek heeft een single-lens gemaakt, waarmee hij single-celled
microben kon waarnemen.
Robert Hooke vond het woord ‘’cell’’ ui en ook verschillende lezen.
Standaard vormen van bacteriën
Golflengte van zichtbaar licht ~ bacteriële cel
Als je iets wilt zien, moet het groter zijn dan de golflengte die je gebruikt om het gene te
zien. Voor bacteriën zou dat betekenend dat je een hele kleine golflengte nodig zou hebben.
Een golflengte van 10^5 heeft het licht wat wij kunnen waarnemen.
Bright field mycroscopi
- Microscopie die de eenvoudigste is van de reeks techonologiën.
- Het typische uiterlijk an een helderveldmicroscopiebeeld is een donker monster op
een heldere achtergrond komt de naam vandaan
Oil emersion
- Wordt gebruikt bij lichtmicroscopie
, - Immersieolie heeft een bepaalde brekingsindex, waardoor er genoeg licht in de lens
valt om de bacterie waar te nemen.
Gram strain
Als je naar een bacterie wilt kijken, moet je de celwand een kleur geven
Gram negatief: celwand is heel dun (E.coli)
Gram positief: celwand is heel dik (B.subtilis)
Negative strain = kleurt de achtergrond, waardoor de capsules beter waarneembaar worden
gemaakt.
DAPI
- Afkorting van 4,6-diamindino-2-fenylindool een fluorescerende stof die vooral aan
chromatine bindt
- Bij fluorescente microscopie absorbeert het monster licht met een golflengte en
zendt vervolgens licht uit met een lagere energie, dus grotere golflengte
Immunflofluorescence
- Fluoresence microscopie: DNA in de kern is gekleurd
- Fluorphore = het fluorescente bestandmiddel
- Immunofluorescence = maakt gebruik van de specifiteit van antilichamen tegen hun
antigenen om fluorescente kleurstoffen te tichten op specifieke biomoleculen in een
cel.
o Maakt visualisatie van de distributie van het doelmolecuul door het monster
mogelijk.
- Primary antibody = het antilichaam die aan de antigeen zit
- Secondary antibody = het antilichaam die aan de primary antibody zit met een
marker aan zich gevestigd.
GFP
- Komt uit een kwal
- Green Fluorescent Protein
- Komt alleen tot expressie als alle voedingsstoffen op zijn daardoor die je alleen de
nieuwe cellen
- GFP-fusie maakt onderzoek naar eiwitlocatie mogelijk
Phase contrast microscope
Onthult verschillen in brekingsindex als patronen van licht en donker kan worden gebruikt
om levende cellen en cellulaire organellen te bekijken.
