Samenvatting microbiologie
HC 1 the evolution of microorganisms and microbiology
Micro Organismen bestaan uit cellen of uit acellulaire structuren. schimmels of protisten bijv.
cellulaire micro organismen behoren bij de prokaryoten en die hebben andere cel opbouw
van de cel dan eukaryoten. Cytoskelet ontbreekt en bepaalde organellen ook. ook manier
van genregulatie is anders. prokaryoten → geen membraan, geen kern. Er zijn zoveel
verschillende typen prokaryoten, dat we ze niet meer enkel prokaryoten kunnen noemen.
Leven op aarde is ontstaan met micro organismen, deze hebben ervoor gezorgd dat er wel
o2 op aarde kwam en dat alle andere levende vormen die we kennen konden ontstaan.
DNA, RNA, eiwit mechanisme is bij sommige micro organismen niet precies zo, veel
complexer.
Alles gaat van DNA naar eiwit, maar de stappen ertussen verschillen. De eerste moleculen
die bestonden zijn RNA moleculen. RNA moleculen kunnen ook enzymatische werking
hebben. Evolutie van soorten gaat vaak via seksuele reproductie, bacteriën doen dat niet.
maar die doen aan horizontale genoverdracht = eigen genetisch materiaal aanvullen met
dat van anderen. Evolutie van 3 domeinen van het leven:
- based on comparisons of small subunit rRNA (SSU rRNA)
- aligned rRNA sequences from diverse organisms are compared and differences
counted to derive a value of evolutionary distance.
- relatedness, but not time of divergence, determined this way.
ribosomen veranderen in bepaalde soorten nauwelijks, omdat ze anders niet functioneren.
als je wilt kijken of organismen op elkaar lijken dan kan je de rRNA sequence van de ene
soort vergelijken met de andere soort en kijken of ze meer verschillen hebben, grotere
evolutionaire afstand.
,bacteria, archaea, eukaryoten (gebaseerd op vergelijking in ribosomaal RNA). Naamgeving
micro organismen berusten op systeem van linnaeus. het gen en de species worden
beschreven. genus: escherichia, species: coli.
Joseph Lister - hygiëne, schoonmaken van handen, instrumenten, wonden
Robert Koch - ontwikkelde technieken om pure microbe culturen te vangen/verkrijgen
Koch’s postulates: bepaalde micro organisme is de veroorzaker van een bepaalde ziekte
1 - micro organismen moet je vinden in zieke personen en niet in gezonde personen
2 - verdachte organisme, moet je kunnen isoleren uit de zieke persoon en die moet kunnen
groeien in pure cultuur.
3 - gezond persoon infecteren met die geïsoleerde ziekteverwekker dan moet die persoon
ziek worden.
4 - Uit die zieke persoon moet je ook weer dezelfde micro organismen (ziekteverwekker)
kunnen isoleren. → er zijn ziektes die hier niet aan voldoen, omdat ze a symptomatisch
aanwezig kunnen zijn. verzaakt dus niet altijd klachten, sommige pathogenen kunnen ook
niet gekweekt worden.
HC 2 deel 1 hoofdstuk 3 - microbial cells and growth
Verschillende verschijningsvormen van bacteriën: belangrijkste celmorfologien zijn de ‘cocci’
en de ‘rods’. Cocci bestaan vaak uit korte ketens genaamd ‘streptococcus’ of ze zijn te
vinden in trosjes ‘staphylococcus’. Ze zijn altijd rond. Rods zijn altijd staafjes.
Je hebt ook bacteriën met hele ongewone vormen:
- Spirillen (gebogen staven)
- spirochetes (hele dunne spiralen)
- pleomorphic bacteria (variabel in vorm)
- filamentous (lange slierten)
Spirillen zijn gebogen staafvormige bacteriën en
hebben vaak 1 flagel aan 1 kant voor extra snelle
beweging. Spirochetes zijn spiraalvormige bacterien
en hebben ook 1 falgel aan 1 kant. pleomorphic
, bacteria zijn bacteriën die constant veranderen van vorm in hele complexe structuren.
Filamentous bacteria zijn multicellulaire bacteriën die mycelium vormen. Bepaalde cellen
hierin kunnen een rol hebben bij stikstof fixatie.
De verschillende vormen zijn geëvolueerd als een bepaalde aanpassing om te overleven.
verhouding tussen opp en volume is relatief groot. Surface/volume ratio is dus groot en dit
stelt je in staat om sneller te groeien en sneller te evolueren. Staafvorm is gunstiger dan een
coc vorm. Groot membraan is dan ook een belangrijk deel (communicatie, energie
generatie, opname/afscheiden voedingsstoffen etc) relatief veel membraan is dus gunstig.
Qua grootte hebben we het over tussen 1 micrometer en 5 micrometer. Virussen zijn kleiner
en eukaryoten zijn groter. Het is fijn om klein te zijn, maar er zit een limiet aan. kleiner dan
10 micrometer is ongunstig. Dingen in de cel hebben dan te weinig ruimte. Pathogene
bacteriën kunnen wel zo klein zijn omdat die gebruik maken van de gastheer.
Prokaryoten zijn 0,2 micrometer tot 700 micrometer in diameter. Rod shaped bacteria
kunnen wel 15 micrometer lang zijn. En eukaryoten zijn tussen de 10 en 200 micrometer in
diameter. Er zijn bij eukaryoten uitzonderingen die wel groter kunnen zijn: Epulopiscium
fishelsoni en Thiomargarita namibiensis.
Epulopiscium fishelsoni bacterie heeft een diameter van 500 micrometer, omdat hij
geëvolueerd is om predatie te voorkomen door eencellige. Intern allerlei membranen
aangemaakt, waardoor toch membraan processen essentieel verlopen en meerdere kopieën
van het genoom bevat. hierdoor is hij niet onnodig te groot.
Hoe zijn bacteriën georganiseerd? binnen naar buiten: nucleoid met dna, cytosol met
ribosomen (soms inclusions, ophopingen van materialen) plasma membrane, cell wall en
uitsteeksels, fimbriae, flagellen. (soms nog met een capsule die om sommige bacteriën zit.
Cell organisatie → cell envelope bestaat uit de plasmamembraan, de cell wall en de
capsule. Plasma membraan ligt direct om het cytoplasma, is een flexibele laag, bestaat uit
een fosfolipide dubbellaag. Hier drijven eiwitten in rond. Dit zijn integraal membraan
eiwitten en perifere membraaneiwitten (die aan integrale membraaneiwitten vastzitten). Er
bevinden zich nog meer lipiden omheen. Dit zorgt voor een vloeibare laag waar eiwitten ruim
kunnen bewegen. Dit heet ook wel het ‘Fluid mozaïek model’. niet alle eiwitten bevinden
zich helemaal los van elkaar. rafts = concentraties van bepaalde eiwitten en lipiden op
bepaalde plekken waardoor ze hun functies beter kunnen uitoefenen.
Het is een vitale
barrière, die cytoplasma
HC 1 the evolution of microorganisms and microbiology
Micro Organismen bestaan uit cellen of uit acellulaire structuren. schimmels of protisten bijv.
cellulaire micro organismen behoren bij de prokaryoten en die hebben andere cel opbouw
van de cel dan eukaryoten. Cytoskelet ontbreekt en bepaalde organellen ook. ook manier
van genregulatie is anders. prokaryoten → geen membraan, geen kern. Er zijn zoveel
verschillende typen prokaryoten, dat we ze niet meer enkel prokaryoten kunnen noemen.
Leven op aarde is ontstaan met micro organismen, deze hebben ervoor gezorgd dat er wel
o2 op aarde kwam en dat alle andere levende vormen die we kennen konden ontstaan.
DNA, RNA, eiwit mechanisme is bij sommige micro organismen niet precies zo, veel
complexer.
Alles gaat van DNA naar eiwit, maar de stappen ertussen verschillen. De eerste moleculen
die bestonden zijn RNA moleculen. RNA moleculen kunnen ook enzymatische werking
hebben. Evolutie van soorten gaat vaak via seksuele reproductie, bacteriën doen dat niet.
maar die doen aan horizontale genoverdracht = eigen genetisch materiaal aanvullen met
dat van anderen. Evolutie van 3 domeinen van het leven:
- based on comparisons of small subunit rRNA (SSU rRNA)
- aligned rRNA sequences from diverse organisms are compared and differences
counted to derive a value of evolutionary distance.
- relatedness, but not time of divergence, determined this way.
ribosomen veranderen in bepaalde soorten nauwelijks, omdat ze anders niet functioneren.
als je wilt kijken of organismen op elkaar lijken dan kan je de rRNA sequence van de ene
soort vergelijken met de andere soort en kijken of ze meer verschillen hebben, grotere
evolutionaire afstand.
,bacteria, archaea, eukaryoten (gebaseerd op vergelijking in ribosomaal RNA). Naamgeving
micro organismen berusten op systeem van linnaeus. het gen en de species worden
beschreven. genus: escherichia, species: coli.
Joseph Lister - hygiëne, schoonmaken van handen, instrumenten, wonden
Robert Koch - ontwikkelde technieken om pure microbe culturen te vangen/verkrijgen
Koch’s postulates: bepaalde micro organisme is de veroorzaker van een bepaalde ziekte
1 - micro organismen moet je vinden in zieke personen en niet in gezonde personen
2 - verdachte organisme, moet je kunnen isoleren uit de zieke persoon en die moet kunnen
groeien in pure cultuur.
3 - gezond persoon infecteren met die geïsoleerde ziekteverwekker dan moet die persoon
ziek worden.
4 - Uit die zieke persoon moet je ook weer dezelfde micro organismen (ziekteverwekker)
kunnen isoleren. → er zijn ziektes die hier niet aan voldoen, omdat ze a symptomatisch
aanwezig kunnen zijn. verzaakt dus niet altijd klachten, sommige pathogenen kunnen ook
niet gekweekt worden.
HC 2 deel 1 hoofdstuk 3 - microbial cells and growth
Verschillende verschijningsvormen van bacteriën: belangrijkste celmorfologien zijn de ‘cocci’
en de ‘rods’. Cocci bestaan vaak uit korte ketens genaamd ‘streptococcus’ of ze zijn te
vinden in trosjes ‘staphylococcus’. Ze zijn altijd rond. Rods zijn altijd staafjes.
Je hebt ook bacteriën met hele ongewone vormen:
- Spirillen (gebogen staven)
- spirochetes (hele dunne spiralen)
- pleomorphic bacteria (variabel in vorm)
- filamentous (lange slierten)
Spirillen zijn gebogen staafvormige bacteriën en
hebben vaak 1 flagel aan 1 kant voor extra snelle
beweging. Spirochetes zijn spiraalvormige bacterien
en hebben ook 1 falgel aan 1 kant. pleomorphic
, bacteria zijn bacteriën die constant veranderen van vorm in hele complexe structuren.
Filamentous bacteria zijn multicellulaire bacteriën die mycelium vormen. Bepaalde cellen
hierin kunnen een rol hebben bij stikstof fixatie.
De verschillende vormen zijn geëvolueerd als een bepaalde aanpassing om te overleven.
verhouding tussen opp en volume is relatief groot. Surface/volume ratio is dus groot en dit
stelt je in staat om sneller te groeien en sneller te evolueren. Staafvorm is gunstiger dan een
coc vorm. Groot membraan is dan ook een belangrijk deel (communicatie, energie
generatie, opname/afscheiden voedingsstoffen etc) relatief veel membraan is dus gunstig.
Qua grootte hebben we het over tussen 1 micrometer en 5 micrometer. Virussen zijn kleiner
en eukaryoten zijn groter. Het is fijn om klein te zijn, maar er zit een limiet aan. kleiner dan
10 micrometer is ongunstig. Dingen in de cel hebben dan te weinig ruimte. Pathogene
bacteriën kunnen wel zo klein zijn omdat die gebruik maken van de gastheer.
Prokaryoten zijn 0,2 micrometer tot 700 micrometer in diameter. Rod shaped bacteria
kunnen wel 15 micrometer lang zijn. En eukaryoten zijn tussen de 10 en 200 micrometer in
diameter. Er zijn bij eukaryoten uitzonderingen die wel groter kunnen zijn: Epulopiscium
fishelsoni en Thiomargarita namibiensis.
Epulopiscium fishelsoni bacterie heeft een diameter van 500 micrometer, omdat hij
geëvolueerd is om predatie te voorkomen door eencellige. Intern allerlei membranen
aangemaakt, waardoor toch membraan processen essentieel verlopen en meerdere kopieën
van het genoom bevat. hierdoor is hij niet onnodig te groot.
Hoe zijn bacteriën georganiseerd? binnen naar buiten: nucleoid met dna, cytosol met
ribosomen (soms inclusions, ophopingen van materialen) plasma membrane, cell wall en
uitsteeksels, fimbriae, flagellen. (soms nog met een capsule die om sommige bacteriën zit.
Cell organisatie → cell envelope bestaat uit de plasmamembraan, de cell wall en de
capsule. Plasma membraan ligt direct om het cytoplasma, is een flexibele laag, bestaat uit
een fosfolipide dubbellaag. Hier drijven eiwitten in rond. Dit zijn integraal membraan
eiwitten en perifere membraaneiwitten (die aan integrale membraaneiwitten vastzitten). Er
bevinden zich nog meer lipiden omheen. Dit zorgt voor een vloeibare laag waar eiwitten ruim
kunnen bewegen. Dit heet ook wel het ‘Fluid mozaïek model’. niet alle eiwitten bevinden
zich helemaal los van elkaar. rafts = concentraties van bepaalde eiwitten en lipiden op
bepaalde plekken waardoor ze hun functies beter kunnen uitoefenen.
Het is een vitale
barrière, die cytoplasma
