Intro:
Metabole netwerk = alle substraten en producten aan elkaar gekoppeld
4 macromoleculen:
- Polysachariden > gemaakt uit suikers
- Vetten > gemaakt uit vetzuren (en glycerol) > membraanstructuren
- Eiwitten > gemaakt uit aminozuren > activiteit
- Nucleïnezuren (bv DNA, RNA) > gemaakt uit nucleotides > informatie
Condensatie en hydrolyse
Amfifatisch = zowel hydrofiel als hydrofoob deel
Verhouding cel is ongeveer: C4H7O2N (P, S, K, Na)
Stabiele conformatie > lage energetische toestand
Instabiel > hoge energetische toestand
1e wet thermodynamica: Energie kan niet gemaakt worden en gaat niet verloren.
Energy before = energy after
2e wet thermodynamica: Bij een energie-omzetting gaat er altijd een beetje
energie verloren aan entropie (perpetuum mobile is niet mogelijk). Chaos van het
universum neemt toe en het kost energie om orde aan te brengen.
dG=dH-TdS > S=entropie, H=energie-inhoud=enthalpie, G=Gibbs free energie
Reactie kan alleen spontaan verlopen als dG<0 (=exergone reactie)
dG hangt af van:
- De aard van de reactanten
- De concentraties van de reactanten
Koppeling van exergone reactie (dG<0, bv ATP hydrolyse) aan endotherme reactie
(dG>0), kan endotherme reactie laten verlopen
Intro + eiwitstructuur:
Enzymkinetiek > Michaelis-Menten
Km = affiniteitsconstante = de substraatconcentratie V=0.5×Vmax
Zonder enzym: rechtevenredig verband tussen substraatconcentratie en
omzettingssnelheid
, Reactiesnelheid is afhankelijk van:
- Hoeveelheid enzym (mate van genexpressie)
- Temperatuur
Allosterische enzymen = enzymen die een andere conformatie krijgen door
binding van een ligand > de active site kan hierdoor hogere of lagere affiniteit
krijgen voor het substraat
Zuur-base reactie: overdracht H+ van donor naar acceptor
Redox reactie: overdracht van e- van donor (reductor) naar acceptor (oxidator)
Oxidatiereactie = er wordt een elektron afgestaan
Reductiereactie = er wordt een elektron opgenomen
Chiraliteit > spiegelbeeldisomeren
In eiwitten komen altijd L-isomeren van aminozuren voor
Aminozuur bij lage pH > NH3+ en COOH
Neutrale pH > NH2 en COOH = zwitterionic form
Hoge pH > NH3 en COO-
Verschil in elektronegativiteit:
Kleiner dan 0.4 > covalente binding, apolair
Tussen de 0.4 en 1.6 > polaire binding
Boven de 1.6 > ionbinding/elektrostatische binding
- Primaire structuur: nucleotidenvolgorde
Metabole netwerk = alle substraten en producten aan elkaar gekoppeld
4 macromoleculen:
- Polysachariden > gemaakt uit suikers
- Vetten > gemaakt uit vetzuren (en glycerol) > membraanstructuren
- Eiwitten > gemaakt uit aminozuren > activiteit
- Nucleïnezuren (bv DNA, RNA) > gemaakt uit nucleotides > informatie
Condensatie en hydrolyse
Amfifatisch = zowel hydrofiel als hydrofoob deel
Verhouding cel is ongeveer: C4H7O2N (P, S, K, Na)
Stabiele conformatie > lage energetische toestand
Instabiel > hoge energetische toestand
1e wet thermodynamica: Energie kan niet gemaakt worden en gaat niet verloren.
Energy before = energy after
2e wet thermodynamica: Bij een energie-omzetting gaat er altijd een beetje
energie verloren aan entropie (perpetuum mobile is niet mogelijk). Chaos van het
universum neemt toe en het kost energie om orde aan te brengen.
dG=dH-TdS > S=entropie, H=energie-inhoud=enthalpie, G=Gibbs free energie
Reactie kan alleen spontaan verlopen als dG<0 (=exergone reactie)
dG hangt af van:
- De aard van de reactanten
- De concentraties van de reactanten
Koppeling van exergone reactie (dG<0, bv ATP hydrolyse) aan endotherme reactie
(dG>0), kan endotherme reactie laten verlopen
Intro + eiwitstructuur:
Enzymkinetiek > Michaelis-Menten
Km = affiniteitsconstante = de substraatconcentratie V=0.5×Vmax
Zonder enzym: rechtevenredig verband tussen substraatconcentratie en
omzettingssnelheid
, Reactiesnelheid is afhankelijk van:
- Hoeveelheid enzym (mate van genexpressie)
- Temperatuur
Allosterische enzymen = enzymen die een andere conformatie krijgen door
binding van een ligand > de active site kan hierdoor hogere of lagere affiniteit
krijgen voor het substraat
Zuur-base reactie: overdracht H+ van donor naar acceptor
Redox reactie: overdracht van e- van donor (reductor) naar acceptor (oxidator)
Oxidatiereactie = er wordt een elektron afgestaan
Reductiereactie = er wordt een elektron opgenomen
Chiraliteit > spiegelbeeldisomeren
In eiwitten komen altijd L-isomeren van aminozuren voor
Aminozuur bij lage pH > NH3+ en COOH
Neutrale pH > NH2 en COOH = zwitterionic form
Hoge pH > NH3 en COO-
Verschil in elektronegativiteit:
Kleiner dan 0.4 > covalente binding, apolair
Tussen de 0.4 en 1.6 > polaire binding
Boven de 1.6 > ionbinding/elektrostatische binding
- Primaire structuur: nucleotidenvolgorde
