Medische microbiologie
Lesweek 1: H29 diagnostiek van infectieziekten
Begrippen:
SOP = standard operating procedures
BSL = BioSafety Level
PPE = personal protective equipment
HAI = Healthcare-associated infectie ook wel nosocomiaal genoemd
HAI’s zijn lastig te behandelen, wat zijn enkele voorbeelden?
- VRE (Vancomycine resistente Enterococcus)
- Norovirus
- MRSA (Meticilline-resistente Staphylococcus aureus)
- ESBL (Extended Spectrum Beta-Lactamase) Enterobacteriaceae, met name E.coli
- Klebsiella pneumoniae
Welke groepen zijn kwetsbaar?
- YOPI Young, Old, Pregnant, Immunocompromised
Wat is specificiteit?
- De mogelijkheid het target te herkennen/aantonen, minimaliseer de kans op vals positieven.
Wat is sensitiviteit?
- De minimale hoeveelheid van het pathogeen dat nodig is voor een positieve test,
minimaliseer de kans op vals negatieven.
Wat zijn de 3 stappen van een gramkleuring?
1. Bacteriën worden gekleurd met een kristalviolet-jodium complex
2. Wassen met alcohol
3. Nakleuren met waterige fuchsine
Welke kleur zijn gram positieve bacteriën en waarom?
- Deze cellen kleuren blauwpaars, omdat het kristalviolet-jodium complex niet weggewassen
wordt door de alcohol.
Welke kleur zijn gramnegatieve cellen en waarom?
- Rood/roze, omdat ze de eerste kleurstof verliezen door het alcoholbad, door de nakleuring
met fuchsine kleuren ze rood/roze.
Waardoor wordt het verschil in kleur veroorzaakt bij gramkleuring?
- Het verschil in de structuur van de celwand: peptidoglycaanlaag. Grampositieve cellen
hebben een dikke laag peptidoglycaan in hun celwand die de kleurstof kristalviolet
gemakkelijk opneemt.
Wat zijn fastidious micro organismen?
- Micro-organismen met speciale groeieisen
Wat is een selectief medium?
- Stoffen in dit medium bevorderen groei van het ene en remmen groei van het andere micro-
organisme. Bijv. galzouten in MacConkey agar of antibiotica
Wat is een electief medium
- Met dit medium kan een micro-organisme geïdentificeerd worden door manier van groeien
of specifieke kleur die ze ontwikkelen. Bijv. EMB plaat of ChromID platen)
, Wat is liqour?
- Cerebrospinaalvocht (hersenruggenmergvocht)
Wat is bacteriëmie?
- Aanwezigheid van bacteriën in het bloed.
Wat is MIC?
- Minimum inhibitory concentration = de laagste concentratie antibioticum waarbij het middel
alle bacteriën remt qua groei.
Hoe kan je MIC bepalen?
- Verdunningsreeksen
- Disk diffusie (Kirby Bauer method)
- E-test
- Vitek
Wat is serologie?
- Antigeen-antistof interacties in vitro meten
Wat is een bekende serologische test?
- ELISA
Wat is convalescence?
- Herstel
Wat is agglutinatie?
- Zichtbare klontering van een specifiek antigeen na samenvoegen met antilichamen tegen dat
specifiek antigeen
Waarmee kunnen antilichamen gemodificeerd worden om zo antigenen of intacte cellen te
detecteren?
- Een fluorescent label
Wat is de directe methode?
- Antilichaam tegen oppervlakte antigeen bevat een fluorescent label.
Wat is de indirecte methode?
- Non-fluorescent antilichaam bindt op antigeen en wordt herkend door fluorescent gelabeld
antilichaam.
Wat is POCT?
- Point of care testing. Bijv. zelftesten
Wat bevestigd de aanwezigheid van een signaal bij een real-time PCR?
- De aanwezigheid van het pathogeen
Wat is reverse transcriptase?
- Bij RT-PCR wordt cDNA gemaakt van RNA
Wat is het verschil tussen kwantitatieve en kwalitatieve real-time PCR?
Lesweek 1: H29 diagnostiek van infectieziekten
Begrippen:
SOP = standard operating procedures
BSL = BioSafety Level
PPE = personal protective equipment
HAI = Healthcare-associated infectie ook wel nosocomiaal genoemd
HAI’s zijn lastig te behandelen, wat zijn enkele voorbeelden?
- VRE (Vancomycine resistente Enterococcus)
- Norovirus
- MRSA (Meticilline-resistente Staphylococcus aureus)
- ESBL (Extended Spectrum Beta-Lactamase) Enterobacteriaceae, met name E.coli
- Klebsiella pneumoniae
Welke groepen zijn kwetsbaar?
- YOPI Young, Old, Pregnant, Immunocompromised
Wat is specificiteit?
- De mogelijkheid het target te herkennen/aantonen, minimaliseer de kans op vals positieven.
Wat is sensitiviteit?
- De minimale hoeveelheid van het pathogeen dat nodig is voor een positieve test,
minimaliseer de kans op vals negatieven.
Wat zijn de 3 stappen van een gramkleuring?
1. Bacteriën worden gekleurd met een kristalviolet-jodium complex
2. Wassen met alcohol
3. Nakleuren met waterige fuchsine
Welke kleur zijn gram positieve bacteriën en waarom?
- Deze cellen kleuren blauwpaars, omdat het kristalviolet-jodium complex niet weggewassen
wordt door de alcohol.
Welke kleur zijn gramnegatieve cellen en waarom?
- Rood/roze, omdat ze de eerste kleurstof verliezen door het alcoholbad, door de nakleuring
met fuchsine kleuren ze rood/roze.
Waardoor wordt het verschil in kleur veroorzaakt bij gramkleuring?
- Het verschil in de structuur van de celwand: peptidoglycaanlaag. Grampositieve cellen
hebben een dikke laag peptidoglycaan in hun celwand die de kleurstof kristalviolet
gemakkelijk opneemt.
Wat zijn fastidious micro organismen?
- Micro-organismen met speciale groeieisen
Wat is een selectief medium?
- Stoffen in dit medium bevorderen groei van het ene en remmen groei van het andere micro-
organisme. Bijv. galzouten in MacConkey agar of antibiotica
Wat is een electief medium
- Met dit medium kan een micro-organisme geïdentificeerd worden door manier van groeien
of specifieke kleur die ze ontwikkelen. Bijv. EMB plaat of ChromID platen)
, Wat is liqour?
- Cerebrospinaalvocht (hersenruggenmergvocht)
Wat is bacteriëmie?
- Aanwezigheid van bacteriën in het bloed.
Wat is MIC?
- Minimum inhibitory concentration = de laagste concentratie antibioticum waarbij het middel
alle bacteriën remt qua groei.
Hoe kan je MIC bepalen?
- Verdunningsreeksen
- Disk diffusie (Kirby Bauer method)
- E-test
- Vitek
Wat is serologie?
- Antigeen-antistof interacties in vitro meten
Wat is een bekende serologische test?
- ELISA
Wat is convalescence?
- Herstel
Wat is agglutinatie?
- Zichtbare klontering van een specifiek antigeen na samenvoegen met antilichamen tegen dat
specifiek antigeen
Waarmee kunnen antilichamen gemodificeerd worden om zo antigenen of intacte cellen te
detecteren?
- Een fluorescent label
Wat is de directe methode?
- Antilichaam tegen oppervlakte antigeen bevat een fluorescent label.
Wat is de indirecte methode?
- Non-fluorescent antilichaam bindt op antigeen en wordt herkend door fluorescent gelabeld
antilichaam.
Wat is POCT?
- Point of care testing. Bijv. zelftesten
Wat bevestigd de aanwezigheid van een signaal bij een real-time PCR?
- De aanwezigheid van het pathogeen
Wat is reverse transcriptase?
- Bij RT-PCR wordt cDNA gemaakt van RNA
Wat is het verschil tussen kwantitatieve en kwalitatieve real-time PCR?