1
NLT Samenvatting Eiwitkristallografie
We willen weten wat eiwitten doen, daarvoor moeten we weten hoe ze (3D) opgebouwd zijn,
daarvoor gebruiken we röntgendiffractie, om dat uit te voeren hebben we eiwitkristallen nodig.
Kristallen maken
Fasen verklaren met behulp van de molecuultheorie
Deeltjes bewegen hogere temperatuur = meer beweging
Deeltjes trekken elkaar aan hogere temperatuur > minder aantrekkingskracht
Aantrekkingskracht Beweging
Gas Geen Zeer snel Wanorde
Vloeibaar Groot Snel Aantrekkende krachten soms verbroken Wanorde
Vast Zeer groot Trillend Aantrekkende krachten permanent Wanorde/orde
In vaste fase:
Wanorde (deeltjes niet regelmatig verdeeld) > amorf
Orde (deeltjes netjes gerangschikt) > kristallijn; stof bestaat uit kristallen
Orde in de wanorde > polykristallijn; kristalgebieden niet gerangschikt t.o.v elkaar
Tijd> ordenen kost tijd. Hoe meer tijd, hoe mooiere ordening
Éénkristal: alle deeltjes perfect gerangschikt zijn t.o.v. elkaar.
Fasediagram: hierin is opgenomen welke fase de stof heeft onder bepaalde
omstandigheden
*Kristal maken het beste uit een oplossing (voor eiwitten enige manier)
Aluin: dubbelzout (2positieve+1negatieve ionsoort) > chemische stof met eigen
stofeigenschappen
Verloop groei éénkristal
Verzadigde oplossing > afkoelen > oververzadigde
oplossing (volgens fasediagram meer ionen opgelost
dan mogelijk bij gegeven temperatuur) > ionen moeten
vast worden, maar waar? >> nucleatie (=ontstaan van
beginpunt: genoeg ionen op goede manier meeten)
Metastabiele fase: geringe oververzadiging, geen
vaste stof, nog net geen stabiele fase (>>metastabiele
gebied in fasediagram: dat waar de oplossing
oververzadigd kan zijn)
Eenheidscel: bevat zo weinig mogelijk deeltjes maar alle eenheidscellen samen
beschrijven de hele structuur (begrip van kristallograven om ordening te beschrijven)
Translatie: het opbouwen van de hele structuur door het verschuiven van de eenheidscel
Verschuiven in horizontale of verticale richting
d.m.v symmetrielijnen (door symmetriepunten) ontstaan eenheidscellen
In vaste stof atomen 3D gerangschikt > 7 kristalsystemen
Kristalgroei en –vorm
Groeirichting wordt aangegeven met coördinaten [0,0,0], handigste als vlakken “groeien in
de richting van een as”. > kijkt dus naar groei van een vlak. Vorm kristal bepaald door de
het langzaamst groeiende vlak
Groeisnelheid kristal bepaald door groeisnelheid in x-, y-, en z-richting
Eiwitkristal: ronde bolletjes die elkaar net raken, hiertussen water (lijkt dus vast) >
kwetsbaar >> (minder kwetsbaar maken) eiwitkristallen bevroren in vloeibaar stikstof
Door water kunnen kleine stoffen makkelijk doordringen in kristal
NLT Samenvatting Eiwitkristallografie
We willen weten wat eiwitten doen, daarvoor moeten we weten hoe ze (3D) opgebouwd zijn,
daarvoor gebruiken we röntgendiffractie, om dat uit te voeren hebben we eiwitkristallen nodig.
Kristallen maken
Fasen verklaren met behulp van de molecuultheorie
Deeltjes bewegen hogere temperatuur = meer beweging
Deeltjes trekken elkaar aan hogere temperatuur > minder aantrekkingskracht
Aantrekkingskracht Beweging
Gas Geen Zeer snel Wanorde
Vloeibaar Groot Snel Aantrekkende krachten soms verbroken Wanorde
Vast Zeer groot Trillend Aantrekkende krachten permanent Wanorde/orde
In vaste fase:
Wanorde (deeltjes niet regelmatig verdeeld) > amorf
Orde (deeltjes netjes gerangschikt) > kristallijn; stof bestaat uit kristallen
Orde in de wanorde > polykristallijn; kristalgebieden niet gerangschikt t.o.v elkaar
Tijd> ordenen kost tijd. Hoe meer tijd, hoe mooiere ordening
Éénkristal: alle deeltjes perfect gerangschikt zijn t.o.v. elkaar.
Fasediagram: hierin is opgenomen welke fase de stof heeft onder bepaalde
omstandigheden
*Kristal maken het beste uit een oplossing (voor eiwitten enige manier)
Aluin: dubbelzout (2positieve+1negatieve ionsoort) > chemische stof met eigen
stofeigenschappen
Verloop groei éénkristal
Verzadigde oplossing > afkoelen > oververzadigde
oplossing (volgens fasediagram meer ionen opgelost
dan mogelijk bij gegeven temperatuur) > ionen moeten
vast worden, maar waar? >> nucleatie (=ontstaan van
beginpunt: genoeg ionen op goede manier meeten)
Metastabiele fase: geringe oververzadiging, geen
vaste stof, nog net geen stabiele fase (>>metastabiele
gebied in fasediagram: dat waar de oplossing
oververzadigd kan zijn)
Eenheidscel: bevat zo weinig mogelijk deeltjes maar alle eenheidscellen samen
beschrijven de hele structuur (begrip van kristallograven om ordening te beschrijven)
Translatie: het opbouwen van de hele structuur door het verschuiven van de eenheidscel
Verschuiven in horizontale of verticale richting
d.m.v symmetrielijnen (door symmetriepunten) ontstaan eenheidscellen
In vaste stof atomen 3D gerangschikt > 7 kristalsystemen
Kristalgroei en –vorm
Groeirichting wordt aangegeven met coördinaten [0,0,0], handigste als vlakken “groeien in
de richting van een as”. > kijkt dus naar groei van een vlak. Vorm kristal bepaald door de
het langzaamst groeiende vlak
Groeisnelheid kristal bepaald door groeisnelheid in x-, y-, en z-richting
Eiwitkristal: ronde bolletjes die elkaar net raken, hiertussen water (lijkt dus vast) >
kwetsbaar >> (minder kwetsbaar maken) eiwitkristallen bevroren in vloeibaar stikstof
Door water kunnen kleine stoffen makkelijk doordringen in kristal
