Samenvatting Genetica 2 Thema 10, DNA

Samenvatning ingenetia 2g
Hoofdstuk 10: DNA structure and analysis

Genetisih matersiaal= DNA
 Repliieersbaars
 Inforsmate opislaan
 Inforsmate tot exprseisisie brseningen
 Varsiateis moingelijk

Teihnieken om te aihtershalen wat de ingenetisihe iode iis:
 Grsifth methode
o Met baitersie met en zonders een islijmlaaing
o Pers keers eiwiten weinghalen, dan het RNA weinghalen en dan het DNA weinghalen
 Hiersbij ingaan kijken of van baitersien zonders islijmlaaing nu wel islijmlaaing
ingevorsmd kan worsden wanneers daars dode baitersieiellen en islijmlaaing
worsden toeingevoeingd.
 Met baitersiofaaing
o Phainge labelen voors DNA en eiwiten. De iellen die dan worsden ingelabeld, dat
iis het ingenetisihe matersiaal.

3 rsedenen om aan te neen dan DNA de ingenetisihe iode iis
1. Golfeningte van DNA en eiwit versisihilt DDNA= 2g0nnm, eiwit= 2gDnnm)8
2g. Hetrsoloinge exprseisisie DNA
3. Haploid en diploid

De baisen:
 Pursine
o Dubbele rsining
o G en A
 Pyrsimidine
o Enkele rsining
o C, U, T

Centrsale doingma:
 DNA RNA
 RNA eiwit

Nuileoiside= - foisfaatingrsoep
Nuileotde= + foisfaatingrsoep
Deoxyrsiboise= H ingrsoep
Riboise= OH ingrsoep

,DNA
 rseihtisdrsaaiende helix
o watison and irsiik
 antparsallel
 minors ingrsoove
 majors ingrsoove Dingen belaningrsijk voors de rseingulate)8
 baisen plat en loodrseiht op de ais
 H brsuingingen DG-C, A-T)8

RNA
Eukarsyoot & prsokarsyoot
 Versisihillende isedimenteisnelheid

Soorsten RNA
 tRNA
 rsRNA
 mRNA
 Svedbersing ioeifiiënt = is Disedementateisnelheid)8
o Hoe isnel iis het RNA op de bodem van het iupjeis

Illumina isequeniining
 Sequeniining by isyntheisining
 Hiiseq& Miiseq
 Maisisive parsrsalell isequeniining
o Genoom in istukken en ingelijk isequenien
 Stappen:
o DNA in willekeursiinge istukken Disonifiate)8
o Grsoote van DNA frsaingment iseleitersen Duit ingel
isnijden)8
o Blund maken DAdapters T overshaning, rseist A
bindt ingoed)8 & adapters liingersen Dbindt aan fow
iel en bevat taing)8
o Denatursersen en versisprseiden overs de fowiel
o Amplifiate van DNA frsaingmenten Dbrsidinge
amplifiate)8
o Reversise istrsand weingknippen en isequenien
o Taing afezen  poolen van isampleis
o Anderse kan isequenien Diomplementait of
parsallel end
 Index pers ingenoom versandersen. Pers fowiel
meersderse ingenomen

Hfst 11: prokaryote replicate
 Prsokarsyote isemiionisersvateve delining
o beingin: DNA N14 ingelabeled
o eersiste delining: 15N en 14 N ingelijk versdeeld

, o tweede delining: meers 15N dan 14N
o na elke isemiionisersvateve delining isteedis meers 15N
 eukarsyote isemiionisersvateve delining
o beinginnen met oningelabeld  labelen  delen
o eindiingd met 2g ingelabelde istrseningen
o versders delen: helf ingelabeld, helf oningelabeled
 kan irsoisis overs plaatisvinden, heb je half in half istrsening
o ionisersvatef: na 1 delining: 1 label, 1 onlabel
o diispersisief: beide istrseningen ingelabeld

Repliiaton forsk:




 Heliiaise: ingrsoene bol
 Siningle istrsand bindining prsotein: ingrsijze dubbelde bolletjeis
 DNA polymersaise III: maakt een istukje met de prsimersis
 Prsimaise
 Prsimers
 Okazaki frsaingment: rsode istukje DNA
 DNA polymersaise I: knipt prsimersis uit en versleningd de istrsand waars de prsimers weing iis
 DNA liingaise: plakt alle okazaki frsaingmenten aan elkaars

DNA polymersaise
I II III
Prsimers nodiing Ja Ja Ja
5’  3’ Ja Ja ja
3’  5’ Ja Ja Ja
exonuileaise
aitviteit
Dprsoofrseadining)8
Dweinghalen alis het
niet klopt)8