Hoorcollege 1(5-9-17): Hoofdstuk 2,3,14
Essentiële aspecten van minimaal leven(macromoleculen):
Eiwitten(aminozuren) voor processen
Aminozurten zitten aan ekaaar vast via een aminebiniin((CNFH).
Biniin( is st era bij pH 7, je aan hem wek weer afreaen via aat akyse of
zuur/basisch maaen. De aminozuren zijn akkemaak het zekfie behakve
ie rest (roep(R). Door aminozuren op een bepaakie vok(orie t e
zetten arij( je een eiwit . een (emiiieki eiwit heeft 375 aminozuren.
We hebben on(eveer 25.000 eiwitten. er zijn aminozuren iie positef
en ne(atef (ekaien zijn.
Mtembranten(vet zuren) voor bijeen houien
Hydrofitel (binnen) en hydrofoob (buit en), zekfor(anisate. Het zor(t
ervoor iat hyirofeke mokecuken binnen vast zitten. Je hebt 2
hyirofeke st aart en(vet zuren), ian een est erbiniin(, (kycerok, en een
hyirofeke aop(fosfaat en akcohok). Het is efectef 1 (root
macromokecuuk ioor zwaaae int eractes.
Nuclteïnte zurten(nuckeotien) voor (eheu(en
Je hebt een covakent e bacabone, met fosfaat (roepen. er zitten functoneke (roepen op, het aan 2 of 3
wat erst of(roepen vormen en zo heb je ius een basepaar. Aks je 1 st ren( hebt aan je ie aniere
st ren( maaen (repkiceren).
(Polysacharidten(suiaers) voor ener(ie opska( en st evi(t e)
Minier bekan(rija, sommi(e kevensvormen hebben iit niet noii(. Het (ebeuri ioor coniensate en
hyirokyse van suiaers. Het (aat over afspkit sen en opnemen van wat er.
Mtetabolte inttermtediërten: t ussenst ofes
Entergite & rtedox co-tenzymten: hukpst ofes
Interacties:
Stterkte intteracttes: Twee at oomaernen ieken een ekeat ron (covakent e biniin( zoaks N-N). Je hebt een
enzym noii( voor het maaen en breaen.
Zwakkte intteracttes: Geen enzym noii( voor het maaen en breaen, je hebt 4 t ypes:
Eltektrostatsch: + t reat – aan.
Watterstofbruggten: Donor at oom en accept or at oom. Het aan met C & H en F & H. Wat er is
non-kineair, hoea is 104,5 (raien.
Van dter Waals: Dipook moment , akein beet je – en akein beet je + bij neut rake at omen.
Hydrofobte intteractte: Verschijnsek ioor een (ebrea aan int eracte. Ze (aan ekaaar juist uit ie
we( iooriat ie wat erint eracte zo st era is. Muurblotempjtes efect .
Interacties tussen macromoleculen
Nuclteïntezuur compltemtentaritteit: Zwaaae int eractes (wek st erae t ussen bacabone).
, Eiwitstructurten: Zwaaae int eractes en st era maar omaeerbaar zoaks S-S bru((en (aks het eiwit op
zichzekf t eru(vouwt ).
Mtembraanstructuur: Zwaaae int eractes (van ier Waaks & hyirofoob) om wat er en
zuurst oftransport mo(ekija t e houien. St era in nooi(evakken, (evonien bij archaea. er is een ant-
int eracte want ie vet zuurst aart en wikken we( van het wat er, vaniaar iat het efectef 1 (root
macromokecuuk is.
Wetten
- De biochemie van akke or(anismen is in essente het zekfie. - Kkuyver
- Akkes is overak maar het mikieu sekect eert . – Baas Becain(
- De biochemie verma( akkes wat chemisch mo(ekija is. – Wij
Je aunt ius wek ze((en wat er noii( is voor het keven, het is in essente het zekfie voor ak het beaenie
keven.
Beperkingen van het leven:
er zijn 7 st ofen noii( voor het keven(ekement en): C, H, N, O, P(DFA), S(cyst eine & met hionine in
eiwitten), micro-teltemtentten(wat je voor macro-ekement en noii( hebt zoaks een akein beet je aobakt of
ijzer). Je aunt chemische ekement en niet in ekaaar omzetten ius iie moet je opnemen.
Nek best aat voor 70% uit wat er. Wat er is noii( voor t ransport via iifusie en osmose.
Hoorcollege 2(6-9-17):
Thermodynamica:
Biochemie heeft ener(ie en ordte noii((t e(enover(est ekie van tentropite).
ener(ie=U, expansie=V, Crie=-S, P=irua, T=absokut e t emperat uur.
Balanswtet((ekit voor akke t ransport eerbare subst antes): Toename subst ante = wat binnen aomt ( -
wat eruit (aat ) + wat er (emaaat worit (- wat verbruiat worit ).
Δ = Import -export + proiucte-consumpte
Entergite aan op(enomen worien aks warmt e (Q), arbeii (W) of in (eïmport eerie st ofen.
Uimport -export = Q + W + Uin op(enomen st ofen
Gecombineeri met ie bakanswet :
Ut oename = Q + W + Uin voeisek + Uproiucte-consumpte
Uproiucte-consumpte = 0 (eerst e hoofiwet t hermoiynamica, ener(ie= behouien in 1 syst eem)
Ut oename = Q + W + Uin voeisek
Calorimtetrite: Zor( ervoor iat er (een arbeii worit verricht en iat ie cek in st eaiy st at e is(U (een
veranierin(). Dan -Q = Uin voeisek. Je bepaaki ie ener(ie inhoui van het voeisek via een warmt e
metn((verbranien).
Fei(in( t ot chaos(tentropite): er is maar 1 manier voor orie, er zijn heek veek manieren voor iezekfie
chaos.
Schrödingter paradox:
Fat uuraunie: Crie chaos
Essentiële aspecten van minimaal leven(macromoleculen):
Eiwitten(aminozuren) voor processen
Aminozurten zitten aan ekaaar vast via een aminebiniin((CNFH).
Biniin( is st era bij pH 7, je aan hem wek weer afreaen via aat akyse of
zuur/basisch maaen. De aminozuren zijn akkemaak het zekfie behakve
ie rest (roep(R). Door aminozuren op een bepaakie vok(orie t e
zetten arij( je een eiwit . een (emiiieki eiwit heeft 375 aminozuren.
We hebben on(eveer 25.000 eiwitten. er zijn aminozuren iie positef
en ne(atef (ekaien zijn.
Mtembranten(vet zuren) voor bijeen houien
Hydrofitel (binnen) en hydrofoob (buit en), zekfor(anisate. Het zor(t
ervoor iat hyirofeke mokecuken binnen vast zitten. Je hebt 2
hyirofeke st aart en(vet zuren), ian een est erbiniin(, (kycerok, en een
hyirofeke aop(fosfaat en akcohok). Het is efectef 1 (root
macromokecuuk ioor zwaaae int eractes.
Nuclteïnte zurten(nuckeotien) voor (eheu(en
Je hebt een covakent e bacabone, met fosfaat (roepen. er zitten functoneke (roepen op, het aan 2 of 3
wat erst of(roepen vormen en zo heb je ius een basepaar. Aks je 1 st ren( hebt aan je ie aniere
st ren( maaen (repkiceren).
(Polysacharidten(suiaers) voor ener(ie opska( en st evi(t e)
Minier bekan(rija, sommi(e kevensvormen hebben iit niet noii(. Het (ebeuri ioor coniensate en
hyirokyse van suiaers. Het (aat over afspkit sen en opnemen van wat er.
Mtetabolte inttermtediërten: t ussenst ofes
Entergite & rtedox co-tenzymten: hukpst ofes
Interacties:
Stterkte intteracttes: Twee at oomaernen ieken een ekeat ron (covakent e biniin( zoaks N-N). Je hebt een
enzym noii( voor het maaen en breaen.
Zwakkte intteracttes: Geen enzym noii( voor het maaen en breaen, je hebt 4 t ypes:
Eltektrostatsch: + t reat – aan.
Watterstofbruggten: Donor at oom en accept or at oom. Het aan met C & H en F & H. Wat er is
non-kineair, hoea is 104,5 (raien.
Van dter Waals: Dipook moment , akein beet je – en akein beet je + bij neut rake at omen.
Hydrofobte intteractte: Verschijnsek ioor een (ebrea aan int eracte. Ze (aan ekaaar juist uit ie
we( iooriat ie wat erint eracte zo st era is. Muurblotempjtes efect .
Interacties tussen macromoleculen
Nuclteïntezuur compltemtentaritteit: Zwaaae int eractes (wek st erae t ussen bacabone).
, Eiwitstructurten: Zwaaae int eractes en st era maar omaeerbaar zoaks S-S bru((en (aks het eiwit op
zichzekf t eru(vouwt ).
Mtembraanstructuur: Zwaaae int eractes (van ier Waaks & hyirofoob) om wat er en
zuurst oftransport mo(ekija t e houien. St era in nooi(evakken, (evonien bij archaea. er is een ant-
int eracte want ie vet zuurst aart en wikken we( van het wat er, vaniaar iat het efectef 1 (root
macromokecuuk is.
Wetten
- De biochemie van akke or(anismen is in essente het zekfie. - Kkuyver
- Akkes is overak maar het mikieu sekect eert . – Baas Becain(
- De biochemie verma( akkes wat chemisch mo(ekija is. – Wij
Je aunt ius wek ze((en wat er noii( is voor het keven, het is in essente het zekfie voor ak het beaenie
keven.
Beperkingen van het leven:
er zijn 7 st ofen noii( voor het keven(ekement en): C, H, N, O, P(DFA), S(cyst eine & met hionine in
eiwitten), micro-teltemtentten(wat je voor macro-ekement en noii( hebt zoaks een akein beet je aobakt of
ijzer). Je aunt chemische ekement en niet in ekaaar omzetten ius iie moet je opnemen.
Nek best aat voor 70% uit wat er. Wat er is noii( voor t ransport via iifusie en osmose.
Hoorcollege 2(6-9-17):
Thermodynamica:
Biochemie heeft ener(ie en ordte noii((t e(enover(est ekie van tentropite).
ener(ie=U, expansie=V, Crie=-S, P=irua, T=absokut e t emperat uur.
Balanswtet((ekit voor akke t ransport eerbare subst antes): Toename subst ante = wat binnen aomt ( -
wat eruit (aat ) + wat er (emaaat worit (- wat verbruiat worit ).
Δ = Import -export + proiucte-consumpte
Entergite aan op(enomen worien aks warmt e (Q), arbeii (W) of in (eïmport eerie st ofen.
Uimport -export = Q + W + Uin op(enomen st ofen
Gecombineeri met ie bakanswet :
Ut oename = Q + W + Uin voeisek + Uproiucte-consumpte
Uproiucte-consumpte = 0 (eerst e hoofiwet t hermoiynamica, ener(ie= behouien in 1 syst eem)
Ut oename = Q + W + Uin voeisek
Calorimtetrite: Zor( ervoor iat er (een arbeii worit verricht en iat ie cek in st eaiy st at e is(U (een
veranierin(). Dan -Q = Uin voeisek. Je bepaaki ie ener(ie inhoui van het voeisek via een warmt e
metn((verbranien).
Fei(in( t ot chaos(tentropite): er is maar 1 manier voor orie, er zijn heek veek manieren voor iezekfie
chaos.
Schrödingter paradox:
Fat uuraunie: Crie chaos
