Hoofdstuk 6: DNA replication and repair
o Basenparing maakt DNA-replicatie mogelijk
DNA replicatie: nodig bij elk proces van celdeling
moederDNA: streng van 5’ 3’ S
en omgekeerde streng van 3’ 5’ S’
5’ vrije fosfaatgroep
3’ vrije OH groep
DNA replicatie is semi-conservatief
strengen van het moederDNA zijn de template strengen en we maken hier
complementair een streng op
o DNA-synthese begint bij replicatie-oorsprongen
o 2 replicatievorken vormen zich bij elke replicatie-oorsprong
Voorafgaand aan ELKE celding is replicatie
Replicatie start ter hoogte van replicatie startplaatsen
zijn plaatsen met voornamelijk AT nucleotiden
Waarom? Hier zijn maar 2 H-bruggen tussen en niet 3 zoals bij C en G
Deze H-bruggen moet dus verbroken worden
1) Initiatoreiwitten verbreken de H-bruggen
2) DNA helicase een enzym die zich gaat plaatsen tussen je 2 DNA strengen om deze 2 strengen
wat uit elkaar te duwen
3) Enkelstreng bindende eiwitten belangrijk dat er bij moederDNA GEEN interne H-bruggen
gevormd worden als dit wel gebeurd proces van replicatie niet meer mogelijk
de ES bindende eiwitten leggen zich dan tegen het DNA zodat deze interne basenparing niet
gevormd kunnen worden
Manieren om snelheid te verhogen
- Aantal replicatie startplaatsen verhogen
- Bidirectioneel gaan werken
o DNA-polymerase synthetiseert DNA met behulp van een ouderstreng als sjabloon
, 4) DNA polymerase gaat de template als basis gebruiken om
nieuwe nucleotiden aan te voeren en nieuwe streng te gaan
maken
de nucleotiden gaan aangevoerd worden via
desoxyribonucleosidentrifosfaten
Condensatiereactie heeft ongunstige delta G waarde (onder nul: >0)
Hoog energetische verbinding
Je hebt 3 fosfaatgroepen achter elkaar en splitst 2 fosfaatgroepen af energie vrij en deze wordt
gebruikt voor onze condensatiereactie
DNA polymerase: heeft actief centrum voor de polymerase activiteit (= verlengen van je dochterDNA /
synthese van dochterDNA)
(A)
o De replicatievork is assymetrisch
Replicatievork = ASYMMETRISCH
Continue synthese en discontinue synthese => de kleine stukjes:
OKAZAKI fragmenten
2 strengen lopen anti-parallel
Op 2 plaatsen continue synthese
2VW :
Strengen moeten antiparallel lopen
Enkel verlengen aan 3’ uiteinden
Dus DNA polymerase heeft
- Polymerase activiteit
- Exonuclease activiteit
zijn 2 tegenoverelkaar staande activiteiten
o DNA-polymerase corrigeert zichzelf (C)
Fout ingebouwd
A ingebouwd tegenover G ipv C
o Basenparing maakt DNA-replicatie mogelijk
DNA replicatie: nodig bij elk proces van celdeling
moederDNA: streng van 5’ 3’ S
en omgekeerde streng van 3’ 5’ S’
5’ vrije fosfaatgroep
3’ vrije OH groep
DNA replicatie is semi-conservatief
strengen van het moederDNA zijn de template strengen en we maken hier
complementair een streng op
o DNA-synthese begint bij replicatie-oorsprongen
o 2 replicatievorken vormen zich bij elke replicatie-oorsprong
Voorafgaand aan ELKE celding is replicatie
Replicatie start ter hoogte van replicatie startplaatsen
zijn plaatsen met voornamelijk AT nucleotiden
Waarom? Hier zijn maar 2 H-bruggen tussen en niet 3 zoals bij C en G
Deze H-bruggen moet dus verbroken worden
1) Initiatoreiwitten verbreken de H-bruggen
2) DNA helicase een enzym die zich gaat plaatsen tussen je 2 DNA strengen om deze 2 strengen
wat uit elkaar te duwen
3) Enkelstreng bindende eiwitten belangrijk dat er bij moederDNA GEEN interne H-bruggen
gevormd worden als dit wel gebeurd proces van replicatie niet meer mogelijk
de ES bindende eiwitten leggen zich dan tegen het DNA zodat deze interne basenparing niet
gevormd kunnen worden
Manieren om snelheid te verhogen
- Aantal replicatie startplaatsen verhogen
- Bidirectioneel gaan werken
o DNA-polymerase synthetiseert DNA met behulp van een ouderstreng als sjabloon
, 4) DNA polymerase gaat de template als basis gebruiken om
nieuwe nucleotiden aan te voeren en nieuwe streng te gaan
maken
de nucleotiden gaan aangevoerd worden via
desoxyribonucleosidentrifosfaten
Condensatiereactie heeft ongunstige delta G waarde (onder nul: >0)
Hoog energetische verbinding
Je hebt 3 fosfaatgroepen achter elkaar en splitst 2 fosfaatgroepen af energie vrij en deze wordt
gebruikt voor onze condensatiereactie
DNA polymerase: heeft actief centrum voor de polymerase activiteit (= verlengen van je dochterDNA /
synthese van dochterDNA)
(A)
o De replicatievork is assymetrisch
Replicatievork = ASYMMETRISCH
Continue synthese en discontinue synthese => de kleine stukjes:
OKAZAKI fragmenten
2 strengen lopen anti-parallel
Op 2 plaatsen continue synthese
2VW :
Strengen moeten antiparallel lopen
Enkel verlengen aan 3’ uiteinden
Dus DNA polymerase heeft
- Polymerase activiteit
- Exonuclease activiteit
zijn 2 tegenoverelkaar staande activiteiten
o DNA-polymerase corrigeert zichzelf (C)
Fout ingebouwd
A ingebouwd tegenover G ipv C
