Samenvatting van het volledige vak moleculaire biologie (17/20 behaald in eerste zit)

Samenvatting moleculaire biologie

geschreven door

2017




www.stuvia.nl




Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen




Samenvatting moleculaire
biologie
Biomedische wetenschappen
2017-2018




Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen



HOOFDSTUK 0: ZELFSTUDIE
1. DNA replicatie
1.1. Inleiding
 DNA replicatie = identieke kopieën maken van het DNA, dit is nodig wanneer de cel gaat
delen
 Volgens AT/GC regel
→ A bindt met T (dubbele binding)
→ C bindt met G (driedubbele binding)
 DNA regelt zijn eigen duplicatie
 Nucleotide = suiker + fosfaatgroep + base

1.2. Proces + betrokken eiwitten
① Ini a e
 Replicon = replicatie-eenheid
 Replicatieoorsprong = origin of replication = plek
waar DNA synthese wordt gestart
 Initatior ontwindt DNA streng aan de origin of
replication

② Lokale ontwinding
 DNA helicase ontwindt DNA streng verder van 5' naar 3'
→ Breekt H-bruggen tussen basen dankzij ATP-hydrolyse
→ Vorming van een replicatievork (= vorm die de
opengeknipte DNA streng krijgt)
 Topoisomerasen = DNA gyrasen maken kleine breuken in de
dubbele helix om supercoiling te voorkomen
→ Enkelstrengig DNA bindende eiwitten = single strand
binding proteins hechten zich vast op ontwonden
strengen om te voorkomen dat ze terug samenklitten

③ RNA priming
 DNA polymerase kan enkel nucleotiden koppelen aan bestaande
nucleotideketens
→ RNA primers worden toegevoegd door DNA primase
→ Primer is complementair aan DNA
 Primers in de leading strand (= 5' naar 3')
→ 1 primer aangemaakt
 Primers in de lagging strand (= 3' naar 5')
→ Meerdere primers aangemaakt

④ Elonga e
 Dankzij DNA polymerase
→ Alleen van 5' naar 3' op de nieuwe streng
→ Deoxynucleoside trifosfaten (= vrije nucleotiden met 3
fosfaatgroepen op) binden met de template strand
→ DNA polymerase breekt de binding tussen de 1e en 2e
fosfaatgroep (geeft energie vrij)
o Nucleotide met 1 fosfaatgroep wordt aangehecht aan de template strand
met een phosphoester bond
 Leading strand:
→ 1 lange leading strand gevormd

2

Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.

, Stuvia - Koop en Verkoop de Beste Samenvattingen



 Lagging strand:
→ Meerdere okasaki fragmenten gevormd
→ Groeit tot het de RNA primer van een ander fragment tegenkomt
 Bidirectionele replicatie = DNA replicatie gebeurt in beide richtingen

⑤ Liga e
 Exonuclease (= DNA polymerase 1) verwijdert RNA
primer
 DNA polymerase 1 vult de lege plekjes met DNA MAAR
er ontbreekt altijd 1 covalente binding
 Ligase plakt deze DNA fragmenten aan elkaar

1.3. DNA replicatie bij prokaryoten
 DNA primase maakt RNA primers
 DNA polymerase III hangt de nucleotiden aan de primers
→ In de lagging strand verwijdert DNA polymerase III meteen de primers en vervangt
deze door DNA
 DNA ligase lijmt de stukken DNA aan elkaar

1.4. DNA replicatie is zeer stabiel: (3) oorzaken
1. H-bruggen tussen A&T en C&G zijn het stabielst
→ Indien bv. A&C per ongeluk binden, zal dit complex zichzelf afbreken omdat het zo
instabiel is
2. DNA polymerase gaat geen bindingen vormen indien er een verkeerd basenpaar is (vb. A&C)
3. Proofreading
→ DNA polymerase herkent fout gematchte nucleotiden en verwijdert deze dan ook
→ Gaat dan even in de 3' tot 5' richting, en keert dan weer om wanneer de basenparen
verwijderd zijn

1.5. Soorten DNA polymerasen
 Evolutie: mutaties hebben gezorgd voor verschillende DNA polymerasen
 Prokaryoten hebben minder soorten DNA polymerasen dan eukaryoten

Prokaryoten Eukaryoten
Soort Functie Soort Functie
 I  Verwijdert RNA primers  α  Maakt RNA primers
 Vult gaten op  Maakt korte DNA strengen
 Herstelt DNA
 III  DNA replicatie  ε, δ  DNA replicatie (snel)
 II, IV, V  Herstelt DNA schade  ϒ  DNA replicatie bij
 Repliceert DNA over DNA mitochondriën
schade
 η,κ,ι,ζ  Repliceert DNA over DNA
schade
 α, β, δ, ε,  Herstelt DNA
σ, λ, μ, φ,
θ
2. Transcriptie = RNA synthese
2.1. Eiwitsynthese bij eukaryoten algemeen
 DNA wordt afgelezen en er wordt een eiwit van gemaakt via het maken van een RNA streng
 Transcriptie = pre-mRNA synthese uit een DNA streng
→ DNA moleculen veranderen hierbij niet

3

Gedownload door: mjpvkampen |
Dit document is auteursrechtelijk beschermd, het verspreiden van dit document is strafbaar.