College 12 20/12/2016 Scheffers
Microbioom
Microbiota naam voor de verzamelde microflora die je meedraagt (huid, mond, darmen)
Microbioom verzameling (niet-menselijk) genetisch materiaal
Mensen dragen meer andere cellen bij zich dan eigen humane cellen.
Archaea prokaryoten, géén bacteriën kunnen bijna overal overleven
Gut microbioom wordt in verband gebracht met
- Obesitas
- Gedrag
- Weerstand
- Vermogen om voedsel af te breken/op te nemen
- Vitamine productie
De pH en de concentratie bacteriën neemt toe van de maag naar het rectum.
16S rRNA sequenties samenstelling flora van de colon
- Dit gen is geconserveerd, essentieel en bevat daardoor weinig mutaties op basis van
variaties in dit gen kan verwantschap worden bepaald
- Tegenwoordig kunnen we hele genomen reconstrueren
Enterotypes drie verschillende clusters van microbiële communities, niet land- of continent-
specifiek.
- Bacteroides/Prevotella/Ruminococcus
- Niet specifiek voor leeftijd, geslacht, lichaamsgewicht
- Varieert over tijd in dezelfde gastheer
- Wel verschil op gen(cluster)niveau
Ouderen meer afbraak zetmeel, minder stress respons (link met minder actief
immuunsysteem)
Kleine verschillen in vitamineproductie
- Enterotypes is evolutionair geconserveerd in great apes, dus niet specifiek voor mensen
Nieuwe studies in mensen
- Niet één bacteriesoort is gedeeld in alle proefpersonen
- Bacteroides – Prevotella sprectrum ipv enterotypes?
Het is logischer dat er een verschuiving in een spectrum is dan een verandering
van een enterotype.
- Microbioom is dieet afhankelijk
Bacteroides eiwit- en vetrijk
Provotella zetmeel, koolhydraatrijk
Probiotica levende bacteriën (bv. yoghurt, yakult)
Prebiotica voedsel voor bacteriën (bv. bananen, zuurkool)
Microbioom bij pasgeborenen
- ‘starter’culture van de moeder tijdens de geboorte is verschillend bij vaginale geboorte of
keizersnee bij vaginale geboorte heeft de baby een soort biofilm wat bescherming
biedt, bij de keizersnee niet
- Geen variatie huid/maag-darm/mond in eerste 24 uur
Microbioom
Microbiota naam voor de verzamelde microflora die je meedraagt (huid, mond, darmen)
Microbioom verzameling (niet-menselijk) genetisch materiaal
Mensen dragen meer andere cellen bij zich dan eigen humane cellen.
Archaea prokaryoten, géén bacteriën kunnen bijna overal overleven
Gut microbioom wordt in verband gebracht met
- Obesitas
- Gedrag
- Weerstand
- Vermogen om voedsel af te breken/op te nemen
- Vitamine productie
De pH en de concentratie bacteriën neemt toe van de maag naar het rectum.
16S rRNA sequenties samenstelling flora van de colon
- Dit gen is geconserveerd, essentieel en bevat daardoor weinig mutaties op basis van
variaties in dit gen kan verwantschap worden bepaald
- Tegenwoordig kunnen we hele genomen reconstrueren
Enterotypes drie verschillende clusters van microbiële communities, niet land- of continent-
specifiek.
- Bacteroides/Prevotella/Ruminococcus
- Niet specifiek voor leeftijd, geslacht, lichaamsgewicht
- Varieert over tijd in dezelfde gastheer
- Wel verschil op gen(cluster)niveau
Ouderen meer afbraak zetmeel, minder stress respons (link met minder actief
immuunsysteem)
Kleine verschillen in vitamineproductie
- Enterotypes is evolutionair geconserveerd in great apes, dus niet specifiek voor mensen
Nieuwe studies in mensen
- Niet één bacteriesoort is gedeeld in alle proefpersonen
- Bacteroides – Prevotella sprectrum ipv enterotypes?
Het is logischer dat er een verschuiving in een spectrum is dan een verandering
van een enterotype.
- Microbioom is dieet afhankelijk
Bacteroides eiwit- en vetrijk
Provotella zetmeel, koolhydraatrijk
Probiotica levende bacteriën (bv. yoghurt, yakult)
Prebiotica voedsel voor bacteriën (bv. bananen, zuurkool)
Microbioom bij pasgeborenen
- ‘starter’culture van de moeder tijdens de geboorte is verschillend bij vaginale geboorte of
keizersnee bij vaginale geboorte heeft de baby een soort biofilm wat bescherming
biedt, bij de keizersnee niet
- Geen variatie huid/maag-darm/mond in eerste 24 uur
