Samenvatting Uitwerking college 2

College 2
- structuur virussen
- taxonomie virussen
- virale replicatie
- prionen en prion-geïnduceerde ziekte
- recombinant dna technologie in microbiologie
- kloneren genen
- probes
- restrictie enzym analyse
- sequencing
- polymerase ketting reactie

VIRUSSEN EN PRIONEN
Virussen zijn klein en horen niet bij prokaryoten of eukaryoten omdat zij een gastheer nodig
hebben. Eigenlijk geen organismen omdat ze zelf niet kunnen voortplanten.
Genoom:
- Het genoom van virussen zit in DNA of RNA. Niet beiden! Het is een DNA of RNA virus.
 Het kan enkelstrengs of dubbelstrengs zijn.
- Monopartiet/multipartiet: komt het genoom als één streng voor, of in meerdere delen.
Mensen zijn multipartiet want die hebben meerdere chromosomen als meerdere
stukken/moleculen van het genoom.
- Daarbij kan de virus nog eens lineair genoom bevatten of circulair.

Ze zijn obligate intracellulaire parasiet: Ze zijn buiten de cel metabool inactief; buiten een cel
kan het zich niet delen of kan het zijn metabolisme niet voortzetten.

Structuur
Bestaat uit:
Je hebt het genoom (nucleïne acid/zuur) daaromheen zit de capside; mantel van eiwitten
gemaakt van capsomeren. Dit mantel beschermt het genoom tegen nucleases (enzymen die
het genoom afbreken) = nucleocapside. Naakte virussen bestaan alleen uit dit. Maar je hebt
ook nog virussen met een envelop eromheen:
Een envelop dient als extra beschermende laag om de nucleocapside. Dit is een bilaag van
lipiden. (lijkt op een membraan, dit komt voor door de gastheer, want eigenlijk neemt dit
virus (een deel van) het gastheer membraan over na vrijkomst uit deze gastheercel.
Een naakte virus is het virus opzich en een envelop virus is een naakte virus met een envelop
eromheen :
Nucleocapside; dna of rna omgeven door een capside (eiwitmantel). Dit beschermt hem
tegen nucleases (enzym dat nucleïne afbreekt) (DIT IS DUS HET HELE VIRUS)
Envelop; extra beschermlaag afkomstig van de gastheer (bilaag van lipide); de virus steelt
deze dus van de gastheer.

, Capside kan verschillend gerangschikt zijn:
- Icosahedraal (de verschillende driehoeken) = paarse plaatje
- Helisch (spiraal vormig) (lijkt op rangschikking dna). Het is dan met capsomeren als muur
opgebouwd en het genetisch materiaal als spiraal.
- Complex; alle andere vormen.

Classificatie
De classificatie tabel hoef je niet uit je hoofd te leren, maar wel de elementen die
aangegeven staan in de dia’s van de powerpoint. Met classificatie wordt gekeken naar:
1. Eerst wordt er gekeken naar: is de virus een DNA virus of een RNA virus. Je ziet links de
DNA virussen staan, rechts de RNA virussen.
2. Heeft de virus een envelop?
3. Is het dubbelstrengs of enkelstrengs? (ss is single strengs en ds is dubble strengs)

Plaatje:
+ss = positieve streng; daar kan je gelijk eiwit van maken
-ss = negatief; dan moet je er eerst positief van maken en dan pas eiwit

Retro virus; rna eerst omzetten in dna en dan weer rna om eiwit ervan te maken. (HIV 
wordt in een ander college uitgelegd)

TAXONOMIE VIRUSSEN
Soorten virussen
DNA virus
Je moet weten dat deze soorten virussen DNA virussen zijn en wat ze doen
 Papovavirussen; kunnen tumoren veroorzaken
- papillomavirussen: veroorzaken wratten (en andere soorten van kanker
zoals baarmoeder halskanker en mond/keel kanker)
- polyomavirussen (maakt niet uit wat ze doen)
 Adenovirussen; infectie van ogen en luchtwegen
 Herpesvirussen; belangrijkste virale bron van orale infecties, het is vaak een herpes
virus die dit veroorzaakt! Eigenschappen:
- Snelle inactivatie door desinfectant (makkelijke bestrijding vooraf)
- Veroorzaken latente infecties = in slapende toestand in het lichaam verblijven waarna ze
dan weer geactiveerd kunnen worden waardoor je daarna weer ziek kan worden
(koortslip bijvoorbeeld)
Herpes virus trekt zich na de infectie terug in een zenuw knoop in je lichaam, en als je dan
even verzwakt (als je bijvoorbeeld iets onder de leden hebt) dan steekt hij de kop op.
 Pokkenvirus
 Parvovirus (hoef je niet te weten maar kan artritis of een dood van de baby in de buik
veroorzaken, ook bij dieren veroorzaakt het ziektes.. niet veel over bekend)
 Hepadnavirus; veroorzaakt o.a. hepatitis. Daar zijn natuurlijk verschillende varianten
van want je hebt hepatitis a,b,c enz. (bij overdracht via bloed of speeksel)